内蒙古生物有机肥料是指以微生物的生命活动导致农作物得到特定的肥料效应，而使作物生长茁壮或产量增加的一类制品，其中微生物的生命活动起着关键作用。其跟普通有机肥的区别在于其中含有大量活性微生物。由于微生物的存在，有机肥不仅仅提高了土壤的有机质，提供给作物需要的氮磷钾等必要养分，还能为其中的微生物生长提供温床，微生物分解有机质不仅可以活化矿质元素，还可以产生大量的纤维素酶、脂肪酶等酶类，促成根系周边的有机质变成多肽、氨基酸等营养或信号物质，刺激植物生长，同时微生物的群体菌落形成，还可以有效的抑制有害土壤微生物，减少病虫害，所以生物有机肥的作用要优于普通有机肥产品。经过烟台农科院专家的多次试验，发现利用烟台本地微生物群落发酵生产的生物有机肥（菌肥）对果树的防病、抗重茬作用极为明显，且能够缓解生产中遇到的大小年问题。值得注意的是由于生物有机肥（菌肥）类产品含有活菌生命体，首先要注意肥料的保存条件要避免潮湿和高温，其次在使用过程中尽量避免与传统高浓度大化肥的混合使用，传统大化肥对活体菌具有一定的生长抑制作用，要达到最理想的使用效果，最好在大化肥施加后隔一段时间再使用生物活性有机肥产品，或者分沟施用。